養(yǎng)殖業(yè)廢水屬于富含大量病原體的高濃度有機廢水，直接排放進入水體或存放地點不合適，受雨水沖洗進入水體，將可能造成地表水或地下水水質(zhì)的嚴重惡化。由于畜禽糞尿的淋溶性很強，糞尿中的氮、磷及水溶性有機物等淋溶量很大，如不妥善處理，就會通過地表徑流和滲濾進入地下水層污染地下水。

養(yǎng)殖廢水中含有大量環(huán)鏈有機化合物(高濃度COD)、疊氮類無機化 合物(尿酸)和氨氮、懸浮物等，這些物質(zhì)無論是進入水體(如排入地面水體或 滲入地下水體)，還是其中的一些物質(zhì)釋放進入大氣，他們都會直接的或間接地對動、植物產(chǎn)生嚴重的危害，破壞生態(tài)環(huán)境。

對地表水的影響則主要表現(xiàn)為，大量有機物質(zhì)進入水體后，有機物的分解將大量消耗水中的溶解氧，使水體發(fā)臭；當(dāng)水體中的溶解氧大幅度下降后，大量有機物質(zhì)可在厭氧條件下繼續(xù)分解，分解中將會產(chǎn)生甲烷、硫化氫等有毒氣體，導(dǎo)致水生生物大量死亡；廢水中的大量懸浮物可使水體渾濁，降低水中藻類的光合作用，限制水生生物的正常活動，使對有機物污染敏感的水生生物逐漸死亡，從而進一步加劇水體底部缺氧，使水體同化能力降低；氮、磷可使水體富營養(yǎng)化，富營養(yǎng)化的結(jié)果會使水體中硝酸鹽和亞硝酸鹽濃度過高，人畜若長期飲用會引起中毒，而一些有毒藻類的生長與大量繁殖會排放大量毒素于水體中，導(dǎo)致水生動物的大量死亡，從而嚴重地破壞了水體生態(tài)平衡；糞尿中的一些病菌、病毒等隨水流動可能導(dǎo)致某些流行病的傳播等。

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